L’objectif global du programme d'appui à la Société Civile de Madagascar était de promouvoir la bonne gouvernance au niveau local et national en œuvrant pour une plus grande indépendance et une crédibilité accrue des ANE.
La présente action visait en priorité à élargir le spectre des bénéficiaires de l’aide européenne parmi les ANE malgaches notamment en favorisant l’appui des acteurs émergents dans le monde rural et les centres urbains :

• Une attention particulière avait été donnée aux associations de jeunes et de femmes. Des actions de renforcement de capacité ciblées, un accompagnement de proximité par des opérateurs qui étaient sélectionnés sur des contrats services, et des voyages d’étude dans la région sont réalisés. En outre, des petites subventions ont été octroyées à un nombre limité d’initiatives en vue de se structurer et d’augmenter leur participation dans la vie économique et sociale ;
• En outre, la transparence, la légitimité, la redevabilité, et les processus de prise de décisions des ANE ont été prises en compte autant que possible dans le programme en vue de renforcer leur crédibilité auprès du citoyen et vis-à-vis du gouvernement, des autorités locales et des PTF. Des initiatives de gouvernance au niveau communal et intercommunal dans des secteurs clés ont été financées et accompagnées ; le concept de formation par l’action et de coaching était appliqué tout au long du processus ;
• Le programme œuvrait également à accroitre la participation des citoyens des zones d’intervention dans la vie politique, économique et sociale. A cet effet, le Programme d'appui à la société civile de Madagascar a financé des projets d’ANE (prioritairement par les ANE de 4ème niveau) impliquées dans la sensibilisation et l’éducation civique des citoyens pour accroitre leur participation dans la vie politique (au niveau national et local) ; en plus, le programme a contribué à faciliter un processus de dialogue multi-acteurs sur le rôle de la société civile en vue de promouvoir un environnement plus propice à l’action des ANE œuvrant dans le domaine ;
• La structuration des ANE impliqués dans des initiatives de gouvernance était promue. Notamment en procédant à l’identification et à l’accompagnement d’initiatives de la société civile pour renforcer leur implication dans le processus de contrôle citoyen de l’action publique (suivi de la mise en œuvre de politiques publiques, suivi du budget, ….) ; Le programme a également appuyé l’échange de bonnes pratiques et d’expériences avec des ANE d’Afrique notamment par l’organisation de voyages d’études ciblés et/ou le jumelage avec des initiatives déjà structurées et fonctionnelles dans la région ;
• Enfin, le programme a facilité la capitalisation des expériences, la production d'informations et de connaissances sur les ANE et sur les opportunités et possibilités pour leur participation à l’élaboration, au suivi et à la mise en œuvre des politiques de développement, ainsi que de promouvoir l’accès à ces informations et connaissances.

Les actions programmées étaient mises en œuvre dans le strict respect des procédures du 10e FED.
Un système de suivi technique, contractuel, financier et comptable permetait de s'assurer que les résultats attendus du programme sont atteints et que les ressources sont mobilisées et utilisées avec toute l'efficacité et l'efficience voulues.