L’économie bleue au Mozambique implique un grand nombre de secteurs et d’institutions, et la gouvernance des ressources marines et côtières du pays est extrêmement complexe, nécessitant une coordination à une échelle que l’on retrouve dans peu d’autres domaines de l’économie nationale. Le gouvernement mozambicain promeut plusieurs réformes visant à améliorer la gestion des ressources marines et océaniques, ainsi qu’une meilleure harmonisation institutionnelle autour du ministère de la Mer, des Eaux intérieures et de la Pêche (MIMAIP). Le MIMAIP élabore actuellement une stratégie d’économie bleue couvrant en priorité les ressources halieutiques, l’énergie, le transport maritime, la conservation de la biodiversité, le tourisme et les questions de sécurité, et inclurait une supervision par un organe consultatif interministériel.
L'objectif spécifique de la mission est de fournir une assistance technique et un soutien à la coordination des donateurs au Mozambique et à la Délégation de l'UE au Mozambique afin de soutenir un dialogue stratégique et opérationnel renforcé dans le domaine du développement économique bleu et de la prise de décision.